Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ddx56Q9D0R4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ddx56Q9D0R4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms