Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zbed3Q9D0L1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbed3Q9D0L1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms