Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nsfl1cQ9CZ44 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nsfl1cQ9CZ44 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms