Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms