Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms