Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ifitm3Q9CQW9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms