Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab5aQ9CQD1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab5aQ9CQD1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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