Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms