Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Chchd1Q9CQA6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms