Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rpa3Q9CQ71 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpa3Q9CQ71 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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