Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Use1Q9CQ56 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Use1Q9CQ56 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Use1Q9CQ56 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Use1Q9CQ56 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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