Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms