Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe41Q99PV5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms