Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt23Q99PS0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt23Q99PS0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt23Q99PS0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt23Q99PS0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt23Q99PS0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms