Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gtf2a1Q99PM3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms