Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nup155Q99P88 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nup155Q99P88 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms