Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ubqln4Q99NB8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ubqln4Q99NB8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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