Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrrtQ99MR6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrrtQ99MR6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms