Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp1b4Q99ME6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms