Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gdpd3Q99LY2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms