Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms