Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp16Q99LG0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp16Q99LG0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms