Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab28Q99KL7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rab28Q99KL7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms