Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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