Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlcd1Q99JT6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms