Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Smim11aQ99J19 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim11aQ99J19 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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