Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc8b1Q925Q3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc8b1Q925Q3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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