Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf7Q922B6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf7Q922B6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms