Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpf6Q91YR7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms