Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl3Q91YH5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms