Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vps4aQ8VEJ9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms