Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8VDP2 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8VDP2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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