Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn4Q8VCH8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms