Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms