Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms