Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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