Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbm48Q8K2X2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms