Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nek9Q8K1R7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Nek9Q8K1R7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nek9Q8K1R7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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