Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Znf628Q8CJ78 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Znf628Q8CJ78 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Znf628Q8CJ78 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Znf628Q8CJ78 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Znf628Q8CJ78 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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