Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms