Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tshz3Q8CGV9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tshz3Q8CGV9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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