Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Upp2Q8CGR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms