Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ercc8Q8CFD5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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