Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc28aQ8CEI3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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