Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc15Q8C9M2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc15Q8C9M2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms