Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrbnQ8C7D2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms