Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms