Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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