Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C5C9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms