Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ssuh2Q8C3L1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ssuh2Q8C3L1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ssuh2Q8C3L1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ssuh2Q8C3L1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms